承租人身份和房屋用途决定是否需要预扣
日本国税厅规定，向非居民个人或外国法人支付日本境内房地产租金时，原则上需要按照支付金额的20.42%预扣所得税及复兴特别所得税。付款方既可能是企业，也可能是个人。但如果个人承租土地或住宅用于本人或亲属居住，则不需要进行这项预扣。因此，同一套海外业主持有的日本公寓，如果租给公司、用于办公室，或由个人作为自住房承租，实际税务处理可能不同。在日本国内支付租金时，预扣税原则上需要在支付月份的次月10日前缴纳。
20.42%同样不是房东最终所得税率
这一20.42%的扣款并不等同于海外业主最终承担的日本租赁所得税率。预扣发生在租金支付环节，而最终日本不动产所得需要根据租金收入和可扣除必要费用等重新计算。为海外业主提供租赁管理时，应在签约之前确认承租人类型和实际用途，因为公司宿舍、办公室和个人自住房在预扣方面可能不同。海外业主也不应仅根据每月实际汇出的净租金判断“日本租赁税率就是20.42%”，而需要把预扣税与最终申报税额区分开来。